
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱海洋生物 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探索导致
科学研究者实验设计随冷冻冷藏箱事件段延缓牛羊肉的硬性、持反击式水轮机、质地、游离子子铁层次、ROS、脂质过硫化物、MDA、GSH和GPX4层次来评定肌肉群组织结构細胞系的铁意外死亡阶段。最终结果展现,冷冻冷藏箱事件段延缓后,牛羊肉的硬性在第六天和第6天不错下滑;持水学习能力拉低;背景色变深,抛弃质感,鲜橘红色的转化成暗橘红色的。凡此种种,游离子子铁、活性酶氧和MDA的层次不错增高,細胞系凋亡率不错增高。 设计职工导入各种之间的关系冰箱周期的力量群原辅料的核球蛋白酶酶质,第二步实现SDS-PAGE研究,核球蛋白酶酶质条带在各种之间的关系五代十国时期地理分布粗糙且相像(图1a)。会按照核球蛋白酶酶在各种之间的关系原辅料中的表达爱前提,研究表明不同组原辅料的中个数快要于不同关卡(图1b),这说明力量群原辅料核球蛋白酶酶质具备有优质的组内相像性和组间之间的关系性。 核血清酶酶质组学共检验出1996种核血清酶酶质。以B0为参考组,建立B1、B2、B4和B6中的核血清酶酶实现不同于之处抒发阐述,共检验到376个DEPs。将火山图可视化管理,并不断地FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05的两个标准规定阐述DEP。最后如下图右图1c-f右图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别检验出22、33、73和140个DEPs,这其中分刘海别上浮6、11、32和8七个,降低16、22、41和5多个。聚类算法的办法分析评估了不同于冰箱价段力量机构中核血清酶酶质的抒发,最后彰显力量核血清酶酶抒发不同于之处不断地放置时的多而多(图1g)。
图1| 有所差异要在冷藏室保存时刻的手臂肌肉仿品蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 其他保鲜用时的肩部肌肉检样差距核蛋白定量分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁致死蛋清肽的PRM降钙素原检测浅析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 根据KEGG生物富集不同表现蛋白质的铁死亡者机理(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物制品提供了TMT化学发光法血清酶质组学方法精准提供服务,拜谱生物学已研发培训完成任务并树立了稳定的稳定的转录组学、血清酶组学、消化吸收组学或者多个学联动產品方法精准提供服务采集体系,欢迎致电咨询!
分类论文资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.