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项目文章(Cancer Letters IF:10.1)|从糖代谢到表观遗传:肝癌进展的隐藏引擎

发布时间:2025-11-21
排泄转化重代码是癌肿发生了和近况的圆形标志,红提糖排泄转化的修改起着管理的本质做用。这一种转换使癌肿体生殖细胞都可以迅猛获取一个动能并会产生必须的排泄转化当中体,最终得以兼容改善成长。既然享有最重要作用,但癌肿体生殖细胞上涨糖酵解的共识机制仍还不够介绍。

近日,南京市医科师范大学第一点附加医生王学浩院土技术团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向治疗能源细胞代谢检测分析服务。

用英语主题词:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)

英文版微信标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路

大家院校:南京医科大学

实验装修材料:细胞

拜谱可以提供服务性:转录组测序+蛋清互作组+靶向药物人体脂肪代谢转化组

技艺路线地图:

研究分析导致

01、YBX1被认定为HCC中糖酵解的重要性什么是基因

本研发录入HCC恶性癌症范例(n=7)的单体神经组织细胞RNA测序的数据了解集来了解,看见糖酵解活性酶主要一起在恶性癌症体神经组织细胞中,hdWGCNA了解判别出9个dna模快(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的长期发展了解判别YBX1为经济独立长期发展风险存在原因(图1H)。进一部结合实际IHC、WB科学实验和恶性癌症安排与临近非恶性癌症安排的三维空间转录组学的数据了解集得知YBX1是肝体神经组织细胞癌医疗的不确定靶点(图1I-K)。

图1:YBX1被确定好为调控HCC组织细胞糖酵解的关键条件条件

02、YBX1使得HCC中的有氧糖酵解和增值能力

为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点力量基础代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。

图2:YBX1促使HCC中的有氧糖酵解和增值能力

03、OGT与YBX1通过并有利于促进YBX1的O-GlcNAc糖基化

为了识别YBX1的调控因子,蛋白质互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。

图3:OGT与YBX1组合并力促YBX1的O-GlcNAc糖基化

04、YBX1的O-GlcNAc糖基化不断增强其磷酸性反应,所以增进其核转位

进步骤测量YBX1的O-GlcNAc糖基化是不是也应响其磷碱化,在OGT敲低的HCC神经细胞膜中或用OGT压药制剂OSMI-1解决,YBX1血清平均的能力强势调低,YBX1磷碱化强势抑制(图4A-C)。IP实验英文出现,在相似的Flag-YBX1底物平均的能力下,YBX1-WT的磷碱化平均的能力强势超出YBX1-T57A,是这原因分析磷碱化的加强不仅是这原因分析更好的YBX1血清表明(图4D)。区分了核和质酚类化合物发觉TMG解决的HCC神经细胞膜中YBX1核表明的增大(图4E-F),进步骤发觉YBX1磷碱化的主要调低要素是AKT(图4G-I)。这么多发觉透露O-GlcNAc糖基化依据加速其磷碱化来加强YBX1血清稳定可靠性并加速核转位。

图 4.YBX1的 O-GlcNAc 遮盖语有助于其再次骤突发磷过酸遮盖语并都可以增强其核转位

05、YBX1催进PKM2转录

前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。

图 5.YBX1促使PKM2转录

06、YBX1 并能从而提高组蛋白质乳硝化作用表达能力

探索显示YBX1敲低明显大大减少血清质乳碱化,特别是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解克剂型2-DG的實驗可确认了糖酵解与组血清乳碱化的之间联系,克制糖酵解可明显大大减少H3K18la标准(图6D)。PKM2过理解不可逆转转YBX1敲低造成的H3K18la越来越低,之外源乳酸加工处理除了提拔H3K18la,还随YBX1理解上浮,系统提示产生正方向汇报(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR可确认,H3K18la借助生物富集于YBX1起动子之间促使其转录,该全过程受O-GlcNAc糖基化调节管控(图6H-J),并显示P300 上浮是YBX1减弱H3K18乳酰化成用的规则(图6K-L)。

图6.YBX1激发H3K18乳酸性反应表达水准

好的文章个人总结

在这方面学习中通讯稿了YBX1在HCC中高传达,或者与糖酵破译切相关内容内容。YBX1在T57处被O-GlcNAc突显,而使维持血清质并加入其传达。一些突显还提高YBX1在T57处的磷酸性反应,提高其核易位。从而,此种步骤提高了糖酵解相关内容内容DNA的转录并刺激作用乳酸的带来。凡此种种,YBX1系统激活P300的转录,继而驱动程序组血清的乳酸性反应,十分是H3K18la,H3K18乳酸性反应同向国家宏观调控YBX1DNA转录(图7)。

图7.Y糖酵解-表观显性基因正反两面馈环长效机制图

拜谱个人心得体会

本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱动物为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向药物热量排泄组技术服务,拜谱菌物建立了完善成熟的转录组学、球蛋白组学、翻译资料后修饰语组学、代谢转化组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!

考生期刊论文

Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.
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