草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿软件模式里比较普遍的病症中的一种。肾组织性中CaOx氯化钠晶体过饱和点火成岩会若想促使肾小管人体细胞伤到和凋亡，若想若想促使肾结石的转变成。短链乳酸的酸由肠管内厌氧厌氧发酵结核杆菌厌氧发酵营养健康合成纤维引起，不在局部位肠管天然屏障中起着用途，并且在软件模式层次上也起着主要用途。这当中，丁酸是最丰富多彩的短链乳酸的酸，兼有抗体减缓和抗体减缓用途,本学习论述丁酸对CaOx肾结石的用途以至于意向靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医疗泌尿整形科吴忠专家、周子健医学博士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠客座教授、周子健研究生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱怪物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网咯临床药理学售后服务，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

内容名字：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 用户厂家：华山医院科室 科研人群：大鼠、HK-2内部 排列讯息：剖析组（Con）、建模组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱供给新技术：网络数据药理学学检则

策略方案图

科学研究成果

钻研人工首选整合大鼠模特，按照生理学生物化学指標和组织化方面的问题学脱色等钻研手法会发现丁酸就可以限制CaOx模特大鼠肾CaOx结晶的达成和挫裂伤，缓和CaOx模特大鼠的炎症病变挫裂伤和被氧化物物质的过早表示。然而，丁酸还可限制草酸介导的HK-2组织挫裂伤、被氧化物应激性和组织凋亡。 为探析性学习丁酸设备构造和靶dna网，探析工作人员从PubChem提高丁酸和丁酸酯的二维和三维图像设备构造（图1A）。经由PharmMapper数据报告表格报告库和Uniprot数据报告表格报告库处理后共选择出117个丁酸靶dna供进三步浅析。将dna列表页拷贝到STRING数据报告表格报告库，组织PPI网浅析。Cytoscape分享了筛选的前20的联络线靶dna的详尽网图，分为CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这样联络线dna与网中的一些dna均表現出必然的一些性，讲解这样dna很有有可能表现着分工协作的用处。GO和KEGG浅析阐明了丁酸联络线dna的一些有效方式和生态学体学能力（图1C）。联络线dna常见与类固醇雄的激素对答、钝化应激状态状态对答、生态学氧细胞系对类固醇雄的激素的刺激的体现迟钝及对酸碱性无机化学有害物质的体现迟钝关以。笔者认为经验，这样联络线dna常见组织了钝化应激状态状态和对生态学氧的生态学体体现迟钝流程，是肾结石导致机制化中至关注重的有效方式，这说明丁酸很有有可能在肾结石中表现注重的用处。

图1| 丁酸架构与靶DNA在线介绍(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一部宇宙探索丁酸对CaOx肾结石确实切靶dna组，科学科学的分析方案工作职工根据GEO数据表格库文件库对GSE73680中良好较与CaOx肾结石糖尿病患病者的dna组不同实现了科学科学的分析方案。较组与CaOx结石糖尿病患病者的有关于性性不同表述dna组（DEGs）产前筛查原则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个dna组会出现有关于性影向，在这其中3379个（89.4%）dna组表述调整，404个（10.6%）dna组表述下跌（图2A）。对DEGs实现聚类分析法分享分享，热图信息显示了前10个被选中DEGs的二维分层现象聚类分析法分享的特征（图2B）。随即，科学科学的分析方案工作职工实现GeneCards数据表格库文件库人造签定了370个几率与CaOx肾结石有关于的dna组，自然排名前20位的予测dna组以及其有关于性打分如下图2C图甲中。想要找回丁酸制疗CaOx肾结石的关键的靶点，科学科学的分析方案工作职工将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关于dna组处理到一堆个Venn图。结果，CYP2C9被选定为丁酸影向CaOx肾结石的不确定性靶点(图2D)。再者，科学科学的分析方案工作职工还实现了丁酸与CYP2C9的原子对接的，CYP2C9的6个安基酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸双方效应，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在再生利用手机网络药理学学预侧CYP2C9是丁酸损害CaOx肾结石的靶DNA后，研发拜谱生物还可以通过肿瘤体细胞实验设计声明了CYP2C9可变低草酸促进的HK-2肿瘤体细胞的ROS水平面、细菌感染伤害和凋亡。

图2| 许多据库共同阐述预计CYP2C9是丁酸使用于CaOx肾结石的靶遗传基因

探讨最后

本深入分析首选显示丁酸在内部和内部均能克制CaOx肾结石建模的硫化的应激性状态和支原体感染伤害，随即依据网药剂学学学建立取到丁酸印象CaOx肾结石的自身靶点——CYP2C9，第四依据体肿瘤细胞研究否认CYP2C9在草酸盐诱发的HK-2体肿瘤细胞ROS质量、支原体感染伤害和凋亡。此类显示阐明丁酸几率依据克制CYP2C9来克制CaOx肾结石的硫化的应激性状态，减弱支原体感染伤害。这个进程中拜谱生物体系统水平可以提供了网药剂学学学系统水平功能，另外拜谱生物体系统水平可增长发育成熟改善的基因遗传组学、蛋白酶质组学、细胞代谢组学等两组学贴心服务及系统水平功能，追捧致电的方式资讯！ 基准文章：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.