
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC表面抗原丰度MHC和运用肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫细胞肽字段同时翻译英语后修饰语产品信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo从脚测序技术水平,不依赖现有数据库,高些通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且很多的数据库解析项目为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递肺部肿瘤抗原的行业
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范例具体分析
01 缘由钻研
好文章考题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
发过半月刊:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)是种核模拟输出淀粉酶,在癌病中通常过表现,做以为癌肿有的推动缘由。现下,靶向治疗XPO1的小氧分子正被充当临床药学抗肿瘤药。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫抗体肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 一款来源于XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 肉瘤-免疫力调理
论文之类:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
发布杂志网站:Nature Communications IF:16.6 2023
恶性瘤胸膜间皮瘤(MPM)就是种继发性恶意的侵蚀性恶性肿瘤。致使目前拥有的疗法计划书由于缺乏较果,如此重要所需新的疗法措施。基于其T受损细胞侵润性,小说家举个例子MPM就是个比较好的疗法性癌症复发预防针的工作目标。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用立于质谱的免疫力肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶劣胸膜间皮瘤免疫系统肽组学监测
03 菌类mRNA预防针定制开发
散文题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
刊发报纸:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过针对质谱的抗体肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌细菌感染的Hela体细胞膜和HCT-116体细胞膜中认定MHC I呈递的抗原肽。
拜谱总结
天然抗体血受损神经元抗体性肽组学是蛋清质组学的其中一个高效的发展的旁支,它致力于探析天然抗体血受损神经元抗体性体统中由包括组织性结构混溶性分手后复合体(MHC)或人类白血血受损神经元抗原(HLA)原子核呈递的天然抗体血受损神经元抗体性肽。这一些天然抗体血受损神经元抗体性肽是血血受损神经元外层呈递的肽段,都可以被T血血受损神经元判断,才能闪避天然抗体血受损神经元抗体性作用。对于质谱的天然抗体血受损神经元抗体性肽组学就已成為鉴别MHC蛋清呈递肽的金要求策略,都可以可以直接鉴别不相同顺利和病理学程序下不相同组织性结构和血血受损神经元型号中的天然抗体血受损神经元抗体性肽组,如物理瘤或类病毒染病的血血受损神经元。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋白酶组学、消化吸收组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫在线检测肽组在线检测业务,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,可以更准确且间接能提供免役细胞肽队列,表明很多非明显免役细胞肽,逐层建立出可信新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
决定性学术论文
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y