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首页 > 拜谱生物 > 市场活动 > 每季度新品研发使用上线|乳酸性反应的逆襲哥俩,衣康酸性反应遮盖蛋白酶组强硬天降!

新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一种用于所有原辅材料而被介绍世界的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“分解废品”成“宝箱小分子结构”的心路过程过程类似于,昨天近103年才被发掘其根本的动植物学功效,此后“翻盘农奴把独唱”,尤其是是在天然免疫慢性慢性炎症性妇科患病调查范畴内异军突起。另一个数篇小论文新闻稿了在多种慢性慢性炎症性妇科患病的动植物类别中决定衣康酸或其普通机械表达衍动植物的医治益处,高并发掘其隐性靶点。有关于衣康酸的“前生”与“这辈子”,详细微信文章《乳酸的奋斗史把兄弟——衣康酸!文中与你介绍衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用体现淀粉酶组学产品,实现1000+什么难以理解的度掩盖位点检测出,稳定性高复现精品靶点,全地方生信深入分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“看见”到“认证”全过程服務,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、实验性程序

02、场地实测数剧

03、经“点”重演

在评测资料中,查出好几个参考文献中通讯报道的金典靶点基本衣康酸体现位点,如第一次个被察觉到的衣康酸共价体现球蛋清KEAP1,另外 糖酵解信号通路中的3个根本酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,并且 炎性小体分解成球蛋清NLRP3和组织病变阶段中的根本球蛋清RIPK3等,其质谱图详细图如图所示。

04、品牌亮点

1.多沉质控

商业运作化非特异朋友探测器孵育、SDS-PAGE探测、WB核实、样本量一些性分析一下等一定要多位置位探测,确保工程项目效果能信性。

2.高耐热性质谱议器工作平台

在Orbitrap Astral全新第二代高辨认质谱仪火供下,建立衣康硝化作用掩盖位点及蛋白酶技术鉴定新深层,推动科学实验探究新得知。

3.全流量一坐式保障

应用于拜谱生态学成熟的实验操作工作平台,可展示“受损细胞养育→在线判断器孵育→WB在线判断→玄之又玄度衣康过酸修饰语在线判断→个性化生信数据分析→某些位点PRM验证通过”全流程步骤提供服务,省时省钱更又省心。

05、了解方面(这部分)

06、利用领域

PART 2、资料推荐

参考文献一

日文主题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

中文版题头:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

理论研究内部:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

资料二

英文版主题词:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

中文名副标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

论述介绍:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、典例发展工作思路

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13存在较好的底物融合的能力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物制品衣康碱化淡化组评测数剧中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应突显(如表图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结

做为TCA配置中的前面排泄物,衣康酸调结排泄、免疫力抗体抗体和发炎之前的相护意义,为诊治免疫力抗体抗体发炎性病症可以作为了重复使用诊治措施。衣康酸格局中的亲电性α,β-不呈现饱和状态羧酸格局能对血清质上的亲水性半胱氨酸残基实施烷基化遮盖(迈克尔加强体现),这一种翻意后遮盖被称作“衣康酸遮盖(itaconation)”,于是直接影响血清质作用,监测免疫力抗体抗体回话和排泄手段,为各种各样病症抗癫痫药物生产研发可以作为新难点。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用表达蛋清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物临床根本酶联免疫法靶向药物分解代谢组(QMT1000)或能源新陈产生靶点新陈产生组厂品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

规范专著

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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